本次申请分二阶段办理，第一阶段先申请取得服替代役资格，第二阶段再依志愿选择入营梯次及服勤地区。
第一阶段由申请役男至内政部役政署网站（http://www.nca.gov.tw）/主题单元/一般替代役申请/「109年(第2次)役男申请服一般替代役甄选作业资讯系统」登录个人基本资料及选服役别机关（选定送出系统后即不得更改），于截止申请日（109年4月24日）前，由役男将身分证明文件及相关专长证照影本，以挂号邮寄内政部役政署始完成申请手续。
经核定取得服替代役资格之役男，得于第二阶段（6月12日～6月15日）依志愿（至多9个）选填入营时间（梯次）及服勤地区（选定送出系统后即不得更改）。
经核定服特定役别机关之役男，依选填志愿筛选结果征集入营；第二阶段未中选者，由主管机关依核定之役别机关勤务需求及第一阶段申请时间先后顺序征集入营服役，服勤地区则依地区缺额办理分发。以一般资格服替代役者，由主管机关依申请时间先后顺序，至迟于109年12月31日前征集入营服役；服役之役别于基础训练期间参加役别甄选（服役机关以本次公告为原则）。
有关109年(第2次)役男申请服一般替代役甄选作业规定及相关资料（专长条件、名额……），可至县府网站「最新消息区」或内政部役政署网站「最新消息区」、一般替代役申请/「109年(第2次)役男申请服一般替代役甄选作业资讯系统」查阅。
如对申请有任何疑问，可电洽户籍地公所役政单位、县府谘询专线：08-7320415转3149或内政部役政署谘询专线：049-2394462。